I. 가이드라인 배경 및 의의
환경부는 환경성과평가지표 개발 및 적용을 통하여 내부적으로 기업의 환경성과 관리 및 개선에 기여하고, 외부적으로는 환경보고서의 수준 향상을 위해 환경성과평가 시범사업을 실시하였고 그 결과로 지난 2005년에 “2005 환경성과평가 가이드라인”을 공표하였다.
2006년 가이드라인은 작년에 가이드라인이 공표된 이후 실시된 환경부 환경경영시범사업을 통해 도출된 다양한 의견을 반영하고 실제 기업이 적용하는데 도움이 되는 방향으로 기존의 구체적인 문제점을 종합 검토하여 개선 및 보완과정을 거친 결과물이다.
환경성과평가 2006 가이드라인은 이번 시범사업 추진과정에서의 경험과 기업 담당자들의 의견을 종합하여 다음과 같은 측면에서 가이드라인을 수정.보완 하였다.
II. 환경성과평가 도입 시 고려사항 및 구축 개요
1. 환경성과평가 정의 및 도입 시 고려사항
(1) 정의 및 도입관련 일반절차
(2) 적용범위에 따른 도입 시 고려사항
2. 환경성과평가 구축 개요
현황 분석, 지표선정, 방법개발, 검토 및 프로그램 개발, 운영
III. 환경성과평가 도입절차 및 방법론
1. 환경경영 현황 분석
(1) 진단 필요성 - 조직 전반에 대한 환경경영 현황을 파악하고 환경성과평가(EPE)시스템 구축 시 반영하기 위한 단계로서 조직경영의 환경측면 및 조직의 특성, 관리역량 등을 진단한다. 진단결과를 통하여 환경성과지표(EPIs) 선정 및 환경성과평가(EPE)시스템 구축 방향 및 계획을 수립하는 것이 바람직하다.
(2) 진단 내용 및 방법 -   진단방법은 현장방문, 인터뷰, 관련문헌 검토, 체크리스트를 통한 진단 및 워크샵 등 목적 및 대상에 따라 적절하게 취사선택하도록 한다. 본 가이드라인에서는 문헌분석, 벤치마킹, 본사 및 현장의 환경진단으로서 진단 내용을 구분하였다.
2. 체계에 대한 검토 및 구축
(1) 환경성과평가지표의 체계 - 환경성과평가는 경영성과지표(MPI)와 운영성과지표(OPI) 그리고 환경여건지표(ECI)가 포함한다.
(2) 환경방침 및 환경경영 전략과의 연계성 검토 -  성과평가 체계를 도입하려는 기업의 경우, 가장 우선적으로 검토해야할 요소는 조직의 환경전략, 환경방침, 목표, 활동, 성과평가가 유기적인 일관성을 갖고 있는지에 대한 충분한 검토가 필요하다. 다시 한 번 말하면 환경방침에는 중요하게 언급한 요소가 성과평가에는 매우 소홀히 취급되거나 혹은 전혀 지표로 선정되지 않는 사례가 빈번이 나타나는 데 이런 점을 검토, 확인하는 것이 필요하다. 이 체계는 회사마다 똑같을 수 없으며 그 회사의 전략적 목표와 절대적으로 연관성이 높아야 한다.
(3) 성과평가체계 사례 및 시사점 - 현재 우리나라 많은 회사들은 환경경영상의 성과지표로서 단순히 사업장의 투입.배출물질 관리지표를 목표관리상의 성과지표로서 이해하고 이를 담당자의 업무성과 및 조직의 성과로서 인식하는 한계성을 가지고 있는데 이러한 부분도 위와 같은 성과평가체계를 설계하여 운영함으로써 개별 단위조직의 성과관리, 조직 구성원의 업무성과평가, 상급책임자의 인사고과, 조직 전체의 성과를 일목요연한 관리를 통하여 개선될 수 있으며 이러한 점에 있어서 기업의 환경경영 성과제고를 위한 평가체계의 올바른 구축은 매우 중요한 의미를 가진다.
3. 환경성과평가 지표선정
(1) 체크리스트 개발 - 체크리스트는 조직의 환경성과지표를 개발하기 위한 준비작업으로서 가능한 많은 이해관계자의 의견을 듣기 위해 인터뷰 및 설문지법에 활용된다. 특히 각 지표가 해당 조직의 환경성과지표로서 타당한지를 판단하기 위한 몇 가지 판단 기준을 제공하는 것이 바람직한데 관리여부, 본사보고, 적용가능성, 개선가능성 그리고 검증가능성 등이 그러한 기준이 될 수 있다.
(2) 이해관계자 의견수렴 - 이해관계자 의견수렴은 적절한 지표를 선정하기 위한 일차적인 목적 이외에도 환경성과평가에 대한 조직의 이해를 도모하고 시스템 도입 및 운영 시 반영되어야 하는 요구사항을 파악하는 기회이다.
(3) 지표별 타당성 분석 - 타당성 분석 시 현 시점에서 측정 가능하고 개선 가능한 지표를 선정하되 추후 고려 가능한 지표의 경우 관리항목으로서 지정하여 지속가능한 환경경영이 유지되도록 해야 한다.
(4) 환경성과평가지표 선정의 예 - 이번 시범사업에서는 산업계에서 일반적으로 활용할 수 있는 일반지표(핵심지표와 부가지표)를 선정하는 것과 동시에 몇 가지 산업군에 대한 특징적인 지표를 언급함으로써 기업이 환경성과평가지표 선정 시 겪는 어려움을 개선하고자 하였다. 단, 산업군별 특성화지표는 해당 산업의 특징에 따라 차별화되는 운영성과지표(OPIs)에 국한된다.
(5) 지표의 확정 - 다시 강조하면 지표명, 지표정의, 데이터 취합규정에 대한 부분이 사내 규정화되어 명확하게 관리되지 않으면 환경성과평가의 결과 자체의 신